応用生物情報学および計算生物学ジャーナル

相同性モデリング

相同性モデリングは、タンパク質の比較モデリングとも呼ばれ、アミノ腐食性連続から「目的の」タンパク質の核決定モデルを開発することを意味します。ホモロジー モデリングでは、関連する相同タンパク質の三次元構造 (「レイアウト」) をテストします。 「相同性を示す」とは、類似表示またはフォーマットベース表示（TBM）とも呼ばれ、既知の仮決定された相同タンパク質の構造をレイアウトとして利用してタンパク質の立体構造を示すことをいいます。

タンパク質の構造は、タンパク質の能力、進歩、リガンドやさまざまなタンパク質との連携の研究、さらには製薬業界内での構造に基づいた医薬品の開示や医薬品の概要の研究に確実に役立ちます。相同性表示により、原子研究者や有機化学者は「低決定性」構造を得ることができ、これにはタンパク質内の必須沈着物の空間的作用経路に関する適切なデータが含まれ、新たな研究の概要を指示できる可能性があります。

たとえば、そのような「低決定性」モデル構造を利用できれば、部位調整突然変異誘発解析の概要を大幅に強化できる可能性があります。タンパク質の構造の試行的な説明は、タンパク質の適切な測定（クローニング、発現、およびミリグラム量の汚染除去）を取得する際の問題や、結晶化に関連する課題によって頻繁に延期される可能性があり、タンパク質の結晶学的部分でさえ問題の源泉となる可能性があります。この状況では、タンパク質構造の予測を管理するシステムの趣味が大幅に増加したことは驚くべきことではありません。これらの手法の中で、相同性を頻繁に表示する戦略は、最も信頼できる結果をもたらします。この技術の利用は、同じファミリーの位置を持ち、比較的アミノ腐食性の連続を有する 2 つのタンパク質が比較的三次元構造を持つであろうという認識に基づいています。