獣医学と医療診断ジャーナル

ディープシーケンスデータベースに基づく傾向クラスター分析による豚臍静脈内皮細胞の豚コレラウイルス感染に対する応答メカニズムの探究

Xiaocheng Gong、Xin You、Xuepeng Li、Aoxue Hu、Zhongxing Wu、Jun He、Pengbo Ning

内皮細胞は、豚コレラ（CSF）を引き起こす豚コレラウイルス（CSFV）感染の主な標的の1つです。CSFの病因は長年研究されてきましたが、根本的なメカニズムを解明するには新しい方法がまだ必要です。ディープシーケンシングに基づくゲノミクス分析は、CSFV感染メカニズムのさらなる研究の可能性を提供します。本研究では、CSFVに対する内皮細胞の重要な遺伝子応答を解釈するために、傾向クラスター分析とバイオインフォマティクス分析が開発されました。CSFV Shimenに寄与する主要な遺伝子は、CSFV C感染およびコントロールとは異なり、特定されました。GO（遺伝子オントロジー）およびKEGG分析は、CSFV Shimen感染がNF-κBの細胞質隔離、アポトーシス過程の調節、Toll様受容体4シグナル伝達経路などの生物学的プロセスの変化を引き起こすことを示唆しました。また、石門感染時には、PI3K-Aktシグナル伝達経路、ウイルス性心筋炎、プロラクチンシグナル伝達経路などから顕著な反応が見られました。ディープシーケンスデータベースのシリーズクラスターに基づく傾向分析により、CSFV石門に対するより優れた解釈が得られ、CSFの発達を理解するためのより貴重な情報が得られました。