植物生理学および病理学ジャーナル

Erwinia amylovora エジプト分離株の分子生物学的同定と他のドイツ株との比較

Shoeib AA、Nader A Ashmawy、Saad M Hammad、Elsayed E. Hafez

Erwinia amylovora エジプト分離株の分子生物学的同定と他のドイツ株との比較

火傷病の原因菌である腸内細菌 Erwinia amylovora の 31 分離株が、エジプトとドイツのさまざまな場所から収集されました。E. amylovora (Ea) 分離株は生化学検査で同定され、得られた結果は 16S ユニバーサルプライマーを使用したポリメラーゼ連鎖反応 (PCR) で確認されました。結果は、調査した分離株はすべて E. amylovora であり、類似性のパーセンテージは異なることが示されました。16S rRNA 遺伝子の DNA ヌクレオチド配列に基づいて構築された系統樹により、エジプトの分離株は特定のルーツを持ち、イタリアの分離株 (AJ746202) と非常に類似していることが明らかになりました。2 つの特定の遺伝子 Amsb1 と PEA29 プラスミドが、調査したすべての分離株で検出され、1600 bp と 1200 bp のアンプリコンが観察されました。さらに、未熟なナシ果実（IPF）試験を用いた病原性毒性試験が実施され、その結果、31の分離株が3つの毒性グループに分けられ、12の分離株は毒性が強く、3つは中程度の毒性、16は弱い毒性であることが明らかになりました。これらの分離株はRAPD-PCRを使用してフィンガープリントも作成され、RAPDデータに基づいて構築された系統樹は、分離株を2つの主要なクラスターに分けました。クラスター1にはすべてのエジプトの分離株が含まれ、クラスター2にはすべてのドイツの分離株が含まれます。密接に関連するErwinia amylovora細菌分離株を区別するには、より具体的な遺伝子を発見する必要があると結論付けることができます。