植物生理学および病理学ジャーナル

Gymnema sylvestre R.Br. における EST-SSR マーカーの開発と検証

Kuldeepsingh A. Kalariya、Lipi Poojara、Dipal Minipara、Parmeshwar Lal Saran、Ram Prasnna Meena、Sinora Macwan、Ponnuchamy Manivel

抗糖尿病作用で知られるギムネマ・シルベスタは、ガガイモ科に属し、南インドの森林が原産です。熱帯アフリカやオーストラリアにも生息しています。この植物のすべての地上部にはアルカロイド、フラボン、サポニンが含まれますが、薬効成分のために使用されるのは主に葉です。形態学的、解剖学的、化学プロファイル、およびランダム増幅多型 DNA (RAPD) と単純反復配列間 (ISSR) マーカーに基づく多様性が報告されていますが、最も効率的な発現配列タグ SSR (EST-SSR) マーカーを介した分子レベルでの遺伝的多様性は、この植物には欠けています。この研究では、膨大なトランスクリプトーム データが生成され、5276 の SSR 遺伝子座が特定されました。ギムネマ・シルベスタの SSR 頻度は1/12.16 kB でした。 AAG/CTT反復はCCG/CGG反復のほぼ10倍でした。合計40対のプライマーが合成され、27のプライマーがインドのさまざまな地域から収集されたG. sylvestreの25の遺伝子型で多型増幅を示しました。遺伝子型DGS 16とDGS 34は最も異なる遺伝子型でした。これは、67.5%という高い転移率を持つEST-SSRマーカーの助けを借りて、 G. sylvestreの遺伝的多様性と高い多型性を明らかにした最初の研究でした。異なるクラスターで同じ状態の遺伝子型が無秩序に分布していることが報告されましたが、これはG. sylvestreが古代から人々が使用している重要な薬用植物であり、さまざまな場所に移動したと推定されるためである可能性があります。