生物多様性管理と林業ジャーナル

西海岸のダグラスモミ（Pseudotsuga menziesii）の葉における緯度勾配を越えた内生菌類のマイクロバイオーム多様性

ヘイゼル・ダニエルズ、ジェド・カペラッツィ、ジム・カイザー  

森林微生物叢の研究は、農作物の研究に比べてはるかに遅れています。宿主と病原体の合併症の理解は、ダグラスモミが優占する森林の落葉に例証されています。この病気は Phaeocryptopus gaeumannii に関連していますが、病因はこれまでに知られている影響とは大きく異なります。気候変数と種子源が原因であると示唆されていますが、潜在的な内生菌の数が多いため、葉枯れ病の単一病原体を分離することは困難です。ダグラスモミの相互起源研究において、緯度勾配に沿った種子源間の内生菌集団を評価するために、ランダム化ブロック設計が使用されました。葉は表面殺菌され、プレート培養されました。分離された菌類コロニーは、サンガー配列決定によって特定され、BLAST によって分析されました。種子源と環境勾配の違いは、対数オッズ比によって分析され、コミュニティの関係は、双方向クラスター分析によって特定されました。線型混合モデルを使用して、種子源データに関連するランダム誤差を評価しました。 39 の分類群から 46 の固有の分離株が特定されました。全針葉の感染率は 39% で、種子源間で 5% から 60% の範囲でした。3 つのサイトでは、非種子源針葉の感染率がより高くなりました。コミュニティ構造分析により、サンプル単位とエンドファイト種との関係が示され、大陸性変数とエンドファイトの平均数との関係に種子源の種類が影響を与えるという強力な証拠があります。順序付けにより、サイト間でエンドファイトコミュニティに違いがあるという証拠がいくつか示され、種子源の種類によってもたらされる影響は克服されています。この研究は、これまでに知られているダグラスモミのエンドファイトのリストを拡張し、環境変数と種子源の起源に基づく菌類コミュニティ構造の概要を示します。この研究は、ダグラスモミの葉の菌類の生物多様性が非常に多様であり、種子源の起源や生育地の気候などの環境変数によって影響を受ける可能性があることを実証しました。マイクロバイオームコミュニティへの関心は、必然的に管理方法の進歩につながります。